وجاء في التقرير :
حسب معدل طفرات الحذف بقي من عمر الفايروس اقل من شهرين حتى ينتهي .
سلسلة التعرف على منطقة ال ORF
بداية نبدأ بال ORF8
منطقة ال ORF8 في فايروس SARS-CoV 2 اهميتها !!!
منطقة ال ORF8 في الفايروس هي اهم المناطق في RNA الفايروس فهي التي تحدد خطورة الفايروس وفتكه
فهي المنطقة التي تشفر بروتينات اهمها بروتين شبيه الهيستون (histone mimics) الذي يلعب دور رئيسي في تثبيط وتمويه على جهاز المناعة من خلال ايقاف انتاج ال انتيرفيرون من النوع الاول type I interferons
والسايتوكاين cytokines التي تعمل على ايقاف نسخ الفايروس نفسه داخل الخلايا المجاورة
بالمختصر اذا دخل الفايروس الى خلية وكاثر نفسه فهناك الية دخل هذه الخلية تكتشف انها تعرضت لهجوم فتحفز منطقة في ال DNA البشري الذي ينتج السايتوكاين الذي يعتبر كرسالة طواريء للخلايا المجاورة للخلية التي تعرضت للهجوم لتخبر الخلايا المجاورة انها قد تعرضت لهجوم فايروسي مما يحفز الخلايا المجاورة من انتاج الانترفيرون النوع الاول الذي يمنع الفايروسات من الدخول اليها والتكاثر فيها .
نعود الى منطقة ال ORF8 في الفايروس هذه المنطقة تنتج بروتينات وأهمها بروتين شبيه الهيستون الذي يدخل الى داخل الجينوم البشري ويمنعه من انتاج السايتوكاين الذي وبالتالي لا يتم تحذير الخلايا المجاورة فيقوم الفايروس ب احتلال كل الخلايا المجاورة .
يقدر طول ال ORF8 ب 121 حمضاً امينياً
لذلك عندما يحدث طفرات حذف في هذه المنطقة يجعل مهمة جهاز المناعة سهلة جداً للسيطرة على الفايروس فيفقد الفايروس سلاح التمويه والتخفي من جهاز المناعة .
ففي السلالات الجديدة المكتشفة في كل من بريطانيا والدينمارك والبرازيل وجنوب افريقيا واليابان لوحظ ان منطقة ال ORF8 قد ازيحت بالكامل في كل هذه السلالات قد فقدت 382 نيوكليوتايد من مادتها الوراثية
وكما ذكرنا سابقاً ان عدد الاحماض الامينية في منطقة ال ORF8 هي 121 حمض اميني حيث لوحظ في جميع السلالات الجديدة وخاصة المكتشفة في بريطانيا ان ال stop codon اصبح في الحمض الاميني رقم 27
وهذا يدل على تلف هذه المنطقة كاملةً
وفي الدراسة المرفقة من مجلة ال lancet من سنغافورة تحدثت ان من اصيب بالسلالة الجديدة كانت حالتهم بين الخفيفة والمتوسطة ولم يحتج اي منهم الى تدخل تنفسي .
حيث ذكر في الدراسة المرفقة من مجلة biorxiv ان فقدان الفايروس ل 382 نيوكليوتايد في مادته الوراثية قد اتلف منطقة ال ORF8 كاملة وأثر على منطقة ال N التي تنتج بروتينات الغلاف
وحسب ما نشر سابقاً عن فايروس السارس المكتشف في الصين عام 2003 فإن حذف 29 نيوكليوتايد من منطقة ال ORF8 كان السبب في اختفاء الفايروس ونهايته حسب الدراسة المرفقة من مجلة ال nature .
معظم العلماء يركزون على طفرات البروتين التاجي وسرعة انتشار الفايروس ولكنهم يهملون اهم منطقة بالفايروس التي تعتبر سلاحه وهي منطقة ال ORF
معدل طفرات الحذف هي 31 نيوكليوتايد شهرياً وهذا كفيل بعد اقل من شهرين بتخريب منطقة ال N المسؤلة عن انتاج الغلاف وبالتالي انتهاء واختفاء هذا الفايروس حيث ان طفرات الحذف حالياً بدأت تؤثر على منطقة ال N بعد ان اتلفت منطقة ال ORF8
لذلك فإن السلالات الجديدة ما هي الى فايروس مضعف ولقاح طبيعي .
وجاء في التقرير :
حسب معدل طفرات الحذف بقي من عمر الفايروس اقل من شهرين حتى ينتهي .
سلسلة التعرف على منطقة ال ORF
بداية نبدأ بال ORF8
منطقة ال ORF8 في فايروس SARS-CoV 2 اهميتها !!!
منطقة ال ORF8 في الفايروس هي اهم المناطق في RNA الفايروس فهي التي تحدد خطورة الفايروس وفتكه
فهي المنطقة التي تشفر بروتينات اهمها بروتين شبيه الهيستون (histone mimics) الذي يلعب دور رئيسي في تثبيط وتمويه على جهاز المناعة من خلال ايقاف انتاج ال انتيرفيرون من النوع الاول type I interferons
والسايتوكاين cytokines التي تعمل على ايقاف نسخ الفايروس نفسه داخل الخلايا المجاورة
بالمختصر اذا دخل الفايروس الى خلية وكاثر نفسه فهناك الية دخل هذه الخلية تكتشف انها تعرضت لهجوم فتحفز منطقة في ال DNA البشري الذي ينتج السايتوكاين الذي يعتبر كرسالة طواريء للخلايا المجاورة للخلية التي تعرضت للهجوم لتخبر الخلايا المجاورة انها قد تعرضت لهجوم فايروسي مما يحفز الخلايا المجاورة من انتاج الانترفيرون النوع الاول الذي يمنع الفايروسات من الدخول اليها والتكاثر فيها .
نعود الى منطقة ال ORF8 في الفايروس هذه المنطقة تنتج بروتينات وأهمها بروتين شبيه الهيستون الذي يدخل الى داخل الجينوم البشري ويمنعه من انتاج السايتوكاين الذي وبالتالي لا يتم تحذير الخلايا المجاورة فيقوم الفايروس ب احتلال كل الخلايا المجاورة .
يقدر طول ال ORF8 ب 121 حمضاً امينياً
لذلك عندما يحدث طفرات حذف في هذه المنطقة يجعل مهمة جهاز المناعة سهلة جداً للسيطرة على الفايروس فيفقد الفايروس سلاح التمويه والتخفي من جهاز المناعة .
ففي السلالات الجديدة المكتشفة في كل من بريطانيا والدينمارك والبرازيل وجنوب افريقيا واليابان لوحظ ان منطقة ال ORF8 قد ازيحت بالكامل في كل هذه السلالات قد فقدت 382 نيوكليوتايد من مادتها الوراثية
وكما ذكرنا سابقاً ان عدد الاحماض الامينية في منطقة ال ORF8 هي 121 حمض اميني حيث لوحظ في جميع السلالات الجديدة وخاصة المكتشفة في بريطانيا ان ال stop codon اصبح في الحمض الاميني رقم 27
وهذا يدل على تلف هذه المنطقة كاملةً
وفي الدراسة المرفقة من مجلة ال lancet من سنغافورة تحدثت ان من اصيب بالسلالة الجديدة كانت حالتهم بين الخفيفة والمتوسطة ولم يحتج اي منهم الى تدخل تنفسي .
حيث ذكر في الدراسة المرفقة من مجلة biorxiv ان فقدان الفايروس ل 382 نيوكليوتايد في مادته الوراثية قد اتلف منطقة ال ORF8 كاملة وأثر على منطقة ال N التي تنتج بروتينات الغلاف
وحسب ما نشر سابقاً عن فايروس السارس المكتشف في الصين عام 2003 فإن حذف 29 نيوكليوتايد من منطقة ال ORF8 كان السبب في اختفاء الفايروس ونهايته حسب الدراسة المرفقة من مجلة ال nature .
معظم العلماء يركزون على طفرات البروتين التاجي وسرعة انتشار الفايروس ولكنهم يهملون اهم منطقة بالفايروس التي تعتبر سلاحه وهي منطقة ال ORF
معدل طفرات الحذف هي 31 نيوكليوتايد شهرياً وهذا كفيل بعد اقل من شهرين بتخريب منطقة ال N المسؤلة عن انتاج الغلاف وبالتالي انتهاء واختفاء هذا الفايروس حيث ان طفرات الحذف حالياً بدأت تؤثر على منطقة ال N بعد ان اتلفت منطقة ال ORF8
لذلك فإن السلالات الجديدة ما هي الى فايروس مضعف ولقاح طبيعي .
